Es una decisión dificil. Personalmente creo que lo realemente importante es plantearse para qué quieres el coche.
Si es un coche que vas a utilizar para conducir todos los dias para ir a trabajar o a cualquier parte, si tienes familia o vas a cargar el coche muchas veces pues el Jetta probablemente sea la eleccion mas lógica ya sea por su espacio, motor con consumos relativamente contenidos etc ...
Si por el contrario el coche lo quieres para disfrutar de la conduccion, de las sensaciones de conducir un GTI, de su estética y te da igual el consumo yo ni me lo pensaba, iria a por el GTI.
Esperemos haberte servido un poco de ayuda
P.D. El GTI no es nada incomodo, pruebalo pero debes estar muy mal de la espalda para que lo notes incomodo en la conduccion..